الساعة الجزيئية (بالإنجليزية: Molecular clock) هي تقنية تحليل وراثية
تعتمد على فرضية أن الطفرات في جينوم الكائنات الحية تحدث في تتابع وبنمط منتظم
على الفترات الطويلة من الزمن . وتعتمد بالتالي كطريقة رياضية لتقدير الزمن الذي
انفصل فيه نوعان عن سلفيهما أثناء التاريخ التطوري.
الاكتشاف
يرجع اكتشاف مفهوم الساعة الجزيئية لإميل زوكرلاند (Emile Zuckerkandl)
ولينوس پولينڤ (Linus Pauling)في سنة 1962عندما لاحظ كل منهما أن
عدد لاختلافات في تسلل الأحماض الأمينية في صبغ الهيموڤلوبين (وهو پروتين ينقل
الأكسجين في الكريات الحمراء) المنتمية لتحدرات حيوانية مختلفة له علاقة مباشرة
بقدم الفترة التي حدث فيها الانفصال عن أسلافها، كما هو مقدر من السجل الأحفوري.
إستعمال الساعة الجزيئية لتقدير تاريخ الإنفصال يعتمد على طرق أخرى للتأريخ . من
أجل حساب الوتيرة التي يتغير فيها إمتداد للـ DNA، يجب على البيولوجيون أن
يستعملوا تواريخ مقدّرة من تقنيات تأريخ أخرى نسبية (relative) و مُطْلَقَة
(absolute)